Puhdasta huonetta, joka tunnetaan myös nimellä Clean Room, käytetään tyypillisesti osana ammatillista teollisuustuotantoa tai tieteellistä tutkimusta, mukaan lukien lääkkeiden, integroitujen piirien, CRT: n, LCD: n, OLED: n ja mikrolaitteiden näytön valmistus. Puhtaan huoneen suunnittelu on ylläpitää erittäin matalaa hiukkasten tasoa, kuten pölyä, eläviä organismeja ilmassa tai höyrystyneitä hiukkasia. Tarkemmin sanottuna puhdashuoneissa on hallittu pilaantumistaso, joka määritetään hiukkasten lukumäärällä kuutiometriä kohden määritellyllä hiukkaskokolla. Puhdas huone voi myös viitata mihin tahansa mukautuvaan tilaan, joka on suunniteltu vähentämään hiukkasten pilaantumista ja hallitsemaan muita ympäristöparametreja, kuten lämpötila, kosteus ja paine.
Farmaseuttisesti puhdas huone viittaa huoneeseen, joka täyttää EU: n ja PIC/S GMP -ohjeiden liitteessä 1 määritellyt GMP -tekniset tiedot, samoin kuin muut paikallisten terveysviranomaisten vaatimat standardit ja ohjeet. Se on yhdistelmä tekniikan suunnittelua, valmistusta, valmistumista ja operatiivista valvontaa (ohjausstrategia), jota tarvitaan tavallisen huoneen muuntamiseksi puhtaaseen huoneeseen. Monet teollisuudenalat käyttävät puhdasta huonetta, ja kaikilla pienillä hiukkasilla, joilla voi olla kielteisiä vaikutuksia tuotantoprosessiin, on puhdashuoneet.